201. ¿Lo petará el Reguetón? Investigando la evolución de tendencias musicales globales a partir de datos de Spotify, con Fernando Terroso y Jesús Soto

Hilo twitter relacionado del que surge este episodio: https://twitter.com/f_terroso/status/1590359370600419329
Artículo comentado: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1875952122000593
Autores:


https://www.researchgate.net/profile/Andres-Munoz-35

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199. Cómo buscar una posición postdoc (II)

Continuación desde el episodio: 142. Cómo buscar una posición postdoc (I)

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197. Grupos de investigación como bandas de Jazz

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195. Cómo optimizar la etapa postdoctoral con Savíns Puertas Martín

Aquí podéis obtener los datos de contacto con Savíns: https://hpca.ual.es/~savins/

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194. Cómo crear una estructura óptima de podcast de investigación

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190. Supremacía cuántica y futuros tests de Turing

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189. Financiación alternativa para grupos de investigación (II)

Enlaces comentados:

https://scriptus.app/

https://www.sciencefund.io/

Ser dueños de trozos de la NBA: Non Fungible Tokens y Blockchain con Iluminada Baturone

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188. Financiación alternativa para grupos de investigación (I)

Enlaces comentados:

https://www.fecyt.es/es/tematica/crowdfunding

Cómo el crowdfunding salva una investigación del coronavirus en España

Capital Cell

https://www.vitadao.com/

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187. Simulación en computación cuántica, con Elisabeth Ortega Carrasco

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HPC Now:

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186. Cómo incrementar la productividad científica de un grupo de investigación (I)

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Este episodio fue publicado en la versión premium del podcast el 10 de Junio de 2022 y ahora se publica en abierto.

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185. Contrato predoctoral Séneca

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184. Cómo gestionar el correo electrónico en los proyectos de investigación

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Libro GTD comentado: https://gettingthingsdone.com/

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183. Positividad tóxica

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182. 1 de Septiembre y optimismo

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181. La letra pequeña de la inteligencia artificial

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177. Especialización en bio-quimio-informática a largo plazo y carrera investigadora

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176. Áreas de la quimioinformática

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175. Áreas de la bioinformática

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173. Pacto de socios entre grupos de investigación

Os hablo de cómo el concepto de pacto de socios, comúnmente aplicado en el contexto empresarial y de startups, puede y debe ser aplicado también y cómo, para el desarrollo de proyectos de investigación entre varios grupos.

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172. Estructura de biomoléculas (IV). Modelos de grano grueso

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171. Estructura de biomoléculas (III). Predicción mediante dinámica

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170. Estructura de biomoléculas (II). Predicción

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169. Estructura de biomoléculas (I). Bases de datos

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167. Errores típicos al comienzo de la carrera investigadora y búsqueda de ayuda

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166. Mejora el enganche de tus charlas usando «trailers»

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165. Cribado virtual basado en los ligandos

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164. SIBILA: investigación y desarrollo en aprendizaje máquina interpretable mediante supercomputación para la medicina personalizada

Episodio previo sobre el proyecto H2020 REVERT: https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Proyecto-Europeo-H2020-REVERT-Medicina-personalizada-mediante-inteligencia-artificial-etpfse

Paper revisión mencionado: https://www.mdpi.com/1422-0067/22/9/4394

Libro Christoph Molnar «Interpretable Machine Learning»: https://christophm.github.io/interpretable-ml-book/

Paper de SIBILA: https://arxiv.org/abs/2205.06234

Código de SIBILA: https://github.com/bio-hpc/sibila

Comunidad discord BIO-HPC: https://discord.gg/gFNjXGNVxx

Paper BRUSELAS: https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jcim.9b00279

Tesis Antonio Jesús Banegas Luna: http://repositorio.ucam.edu/handle/10952/4124

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160. ¿Qué puerta cierra esa llave? Librerías para cribado virtual (II)

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161. ¿Descubrimiento de compuestos bioactivos en la industria alimentaria?

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159. Preguntas y respuestas (VIII)

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157. Encontrar la aguja en el pajar; librerías de compuestos para descubrimiento de fármacos (I)

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156. Investigación y transferencia tecnológica en longevidad y ciencia descentralizada con Estéfano Pinilla

Estéfano Pinilla:

https://pure.au.dk/portal/en/persons/estefano-pinilla-perez(4e61e1eb-8788-4fc2-9c7c-f34c79aab458).html

https://www.researchgate.net/profile/Estefano-Pinilla/research

Vita DAO:

https://www.vitadao.com/

Y este podcast:

Hola

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155. Computación cuántica dependiente de la aplicación

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154. Preguntas y respuestas (VII)

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152. Investigando la gestión de proyectos con Abel Yécora

Podcast «Proyecta» de Abel: https://emilcar.fm/podcast/proyecta/

Cuenta de Twitter de Abel: https://twitter.com/ayecora?lang=es

TFG de Abel: http://yecora.org/pfg/Final/Memoria.pdf

Hola

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151. Sincronización de notas entre diferentes aplicaciones: Readwise et al.

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150. ¿Puede un grupo de investigación pitchear como una startup?

https://itnig.net/podcast/

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147. Didáctica en las ciencias matemáticas con Carlos Ledezma

https://www.researchgate.net/profile/Carlos-Ledezma-4

https://link.springer.com/article/10.1007/s13394-022-00411-3

https://discord.gg/yEneVTEzDK

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145. Toma de notas basada en agentes

https://maggieappleton.com/programmatic-notes

Hola

Comunidad Discord del podcat: https://discord.gg/uycXsHQYNV

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141. Pint of Science

Hola

https://pintofscience.es/

https://twitter.com/hashtag/pint22es?src=hashtag_click&f=live

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139. Preguntas y respuestas (IV)

Hola

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137. Productividad digital y negocio de podcasting, con Diego Villavicencio

Web de Diego y enlace a su podcast, blog y patreon: https://productividaddigitalblogsite.com

Libros comentados

– GTD: https://gettingthingsdone.com/

– PARA de Tiago Forte: https://fortelabs.co/blog/para/

– La vaca púrpura: https://en.wikipedia.org/wiki/Purple_Cow:_Transform_Your_Business_by_Being_Remarkable

– Cal Newport: https://www.calnewport.com/

– Joan Boluda: https://boluda.com/

Y cualquier comentario que queráis añadir: https://horacio-ps.com

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136. Inicia tus proyectos académicos como una micro startup

Hola

https://t.me/investi_gacion

https://mumbler.io/investigandolainvestigacion

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134. Mejora tu escritura con el desafío #ship30for30

Hola

https://discord.gg/yEneVTEzDK

https://www.ship30for30.com/

https://medium.com/@horacio.eps

https://twitter.com/search?q=%23ship30for30&src=typed_query

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133. Implementación visual y sencilla tipo Zettelkasten con Marginnote3

https://www.marginnote.com

Hola

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132. Webinar sobre PKM, Zettelkasten y Obsidian, (II)

Hola

https://www.youtube.com/channel/UCsdcyr1dNr-ARtYExnb8ChA

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128. Preguntas y respuestas (II)

Enlaces relacionados:

Mi sitio web: https://horacio-ps.com

Comunidad discord: https://discord.gg/yEneVTEzDK

Libros GTD:

Intro Latex:

https://matematicas.uclm.es/earanda/wp-content/uploads/downloads/2013/10/latex.pdf

Versión premium del podcast:

https://anchor.fm/horacio-ps/subscribe

Episodios premium comentados:

Send in a voice message: https://anchor.fm/horacio-ps/message

127. El Método Zettelkasten, de Sönke Ahrens (III)

Libro comentado disponible entre otros, en Amazon: https://www.amazon.es/gp/product/B08KPMP3QK/ref=dbs_a_def_rwt_bibl_vppi_i1

Mis servicios de mentoría y ayuda para implementación del método Zettelkasten en: https://horacio-ps.com

La comunidad de discord del podcast, para discutir sobre todos los contenidos: https://discord.gg/yEneVTEzDK

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126. El Método Zettelkasten, de Sönke Ahrens (II)

Libro comentado disponible entre otros, en Amazon: https://www.amazon.es/gp/product/B08KPMP3QK/ref=dbs_a_def_rwt_bibl_vppi_i1

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125. El Método Zettelkasten, de Sönke Ahrens (I)

Libro comentado disponible entre otros, en Amazon: https://www.amazon.es/gp/product/B08KPMP3QK/ref=dbs_a_def_rwt_bibl_vppi_i1

Libro Digital Zettelkasten, de David Kadavy: https://www.amazon.es/dp/B095VY4XGD?linkCode=gs2&tag=desiforhack-21

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124. Webinar sobre PKM, Zettelkasten y Obsidian

Para acceder al webinar os podéis suscribir a la Newsletter del podcast a través de:

Hola

o en el canal #webinar de nuestra comunidad de Discord:

https://discord.gg/7ahRHsznep

Episodios previos relacionados:

99: https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/99–Encontrar-nuevas-rutas-entre-tus-ideas-con-Obsidian-Journey-e1fmene

93: https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/93–Mi-lucha-para-pasar-de-2-a-3-o-ms-dimensiones-en-la-gestin-de-tareas-y-proyectos-de-Things-3-a-Obsidian-e1f5fh3

87: https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/87–Ausencia-efectiva-de-un-metaverso-para-tu-sistema-digital-de-gestin-del-conocimiento-e1eqtpo

Intro: https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Encuentra-nuevas-relaciones-entre-tus-ideas–PKM–Zettelkasten-y-Obsidian-e1cnpfd

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123. Participa en la competición Blind Docking Server

Comunidad discord del grupo BIO-HPC y detalles sobre cómo participar en la competición del Blind Docking Server:

https://discord.gg/DSMkjFFu

Episodio previo sobre Blind Docking:

Episodio previo sobre METASCREENER:

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119. Crear y procesar contenidos; digital, analógico u otras opciones

Hola

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116. Nanotecnología e investigación en grafeno con Romain Danneau del Instituto Tecnológico de Karlsruhe

Hola

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111. Únete a un Journal Club para aprender cómo acceder a recursos GPU gratis en Google Colab para tus simulaciones (II), con Pablo Arantes de la Universidad de California Riverside

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108. Espacio químico que puede codificar un compuesto para cribado virtual (II)

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107. Detección de túneles y hotspots en proteínas (II), con Maria Bzówka de Silesian University of Technology

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105. Espacio químico que puede codificar un compuesto para cribado virtual

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104. Dinámica Molecular con Hugo Verli de la UFRGS, Brasil

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In this episode we focus around the computer simulation technique Molecular Dynamics (MD), which allows the study of the dynamics of systems of biological relevance. For such purpose we have the pleasure to interview Prof. Hugo Verli from UFRGS, Brazil:

https://scholar.google.com/citations?user=fB-31L4AAAAJ&hl=es

and you can contact via email in case of questions at:

hverli@cbiot.ufrgs.br

or

hugoverli@gmail.com

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98. Audiocurso sobre escritura de artículos científicos (II), planear cómo va a ser tu artículo

Para continuar la discusión sobre el episodio, plantear dudas, etc, puedes hacerlo dentro de nuestra comunidad en discord:

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o mi email: horacio@horacio-ps.com

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Y si necesitas ayuda personalizada para que:

– tus artículos científicos sean aceptados en revistas de alto impacto

– tus proyectos de investigación obtengan financiación en convocatorias competitivas nacionales e internacionales

– puedas gestionar eficientemente tus proyectos de investigación actuales para conseguir los objetivos propuestos

– consigas incrementar tu productividad como investigador/a y disminuir tu estrés

puedes consultar mis servicios de mentoría/consultoría en https://horacio-ps.com

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97. Aprender de manera eficiente explicando a 5 niveles de dificultad

Enlaces relacionados:

– https://www.wired.com/video/series/5-levels#:~:text=In%205%20Levels%2C%20an%20expert,and%2C%20finally%2C%20a%20colleague.

– https://www.goodreads.com/quotes/19421-if-you-can-t-explain-it-to-a-six-year-old

– https://www.colorado.edu/artssciences-advising/resource-library/life-skills/the-feynman-technique-in-academic-coaching

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96. Linux, línea de comandos y computación científica (VI). Por qué y cuándo Linux es mejor que Windows

Enlaces relacionados:

– https://medium.com/swlh/13-reasons-why-linux-is-better-than-windows-6fa304454ae

– https://open.spotify.com/episode/7ztQfqmNPb0Z7Ku0xc9Ijv?si=hCJ4AygtSaatpsfDtqlkmw

– https://open.spotify.com/episode/7h48TtzkyRo5U5iGN3YDeR?si=Bpf8-2sDRj-zzRKzhsgYgw

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95. Evitar la fricción y reconducir al flujo

Enlaces comentados:

– https://es.wikipedia.org/wiki/Getting_Things_Done

– https://es.wikipedia.org/wiki/Niklas_Luhmann

– https://es.wikipedia.org/wiki/Mih%C3%A1ly_Cs%C3%ADkszentmih%C3%A1lyi

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Encuentra-nuevas-relaciones-entre-tus-ideas–PKM–Zettelkasten-y-Obsidian-e1cnpfd

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/87–Ausencia-efectiva-de-un-metaverso-para-tu-sistema-digital-de-gestin-del-conocimiento-e1eqtpo

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94. Convocatorias de financiación para investigación (I)

Este episodio pertenece a la serie de convocatorias de financiación para que los grupos de investigación y empresas, puedan llevar a cabo sus proyectos de investigación. En este episodio presento las características principales que tienen estas convocatorias y hablo también de los requerimientos, y sobre cómo se pueden clasificar a varios niveles. Cuento un ejemplo propio de un proyecto que conseguí como IP en la convocatoria del MINECO Retos 2017 y de cómo se desarrollaron las partes más relevantes del proceso del proyecto. Por último, algunos consejos para los que estáis empezando a pedir proyectos. En próximos episodios profundizaremos en otros detalles importantes de este proceso.

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93. Mi lucha para pasar de 2 a 3 (o más) dimensiones en la gestión de tareas y proyectos: de Things 3 a Obsidian

Enlaces comentados:

Things 3

Obsidian

https://github.com/zsviczian/Obsidian-GTD-plugin

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Encuentra-nuevas-relaciones-entre-tus-ideas–PKM–Zettelkasten-y-Obsidian-e1cnpfd

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/87–Ausencia-efectiva-de-un-metaverso-para-tu-sistema-digital-de-gestin-del-conocimiento-e1eqtpo

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92. Linux, línea de comandos y computación científica (V). Respuestas a preguntas.

Enlaces relacionados:

https://aws.amazon.com/es/ec2/

https://www.res.es/

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91. Audiocurso sobre escritura de artículos científicos (I), entender cómo funciona el sistema. Respuestas a preguntas.

Enlaces relacionados:

https://scholar.google.com/

https://www.scopus.com/

https://es.wikipedia.org/wiki/Web_of_Science

https://www.researchgate.net/

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90. La cada vez mayor presencia de blockchain en el descubrimiento de fármacos

Enlaces relacionados:

– La DAO Molecule: https://molecule.to/

– Episodio previo blockchain y NFT: https://horacio-ps.com/ser-duenos-de-trozos-de-la-nba-non-fungible-tokens-y-blockchain-con-iluminada-baturone/

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89. Taskblocking

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Enlaces relacionados:

”Deep Work” by Cal Newport: https://www.calnewport.com/books/deep-work/

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Y en caso que te interesen mis servicios de mentoría para investigadores y en contextos de productividad puedes contactarme en:

Hola

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88. Grupos de investigación y startups, similitudes y diferencias

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Este es otro episodio en la serie sobre startups. Hoy comentamos las principales diferencias y similitudes entre grupos de investigación y startups, basándome en un post muy interesante de Charl Botha, de la Universidad de Delft:

https://cpbotha.net/2012/07/24/startups-vs-academic-research-groups-fight/

es una exploración de ideas interesante y donde podéis escoger la casuística que preferís. También os dejo una reflexión al final del episodio sobre el tema.

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87. Ausencia efectiva de un metaverso para tu sistema digital de gestión del conocimiento

Enlaces relacionados:

– Windows 95: https://es.wikipedia.org/wiki/Windows_95

Episodio previo sobre PKM, Zettelkasten y Obsidian: https://open.spotify.com/episode/71cEII3QmhZ02NTdjSXtOj?si=SwqTouvrS0OHVZPJ0ha1hg

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86. Simulación de redes de reacciones químicas complejas, con Emilio Martínez Núñez de la USC

Enlaces relacionados:

– Publicación comentada: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsphyschemau.1c00051

– Página web de Emilio Martínez Núñez: http://webspersoais.usc.es/persoais/emilio.nunez/

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85. Linux, línea de comandos y computación científica (IV)

Enlaces relacionados:

https://slurm.schedmd.com/documentation.html

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84. Investigando cómo construir proyectos sobre negocios online en abierto (I)

Enlaces relacionados:

https://es.wikipedia.org/wiki/Lean_startup

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83. Linux, línea de comandos y computación científica (III)

Enlaces relacionados:

https://www.knime.com/

https://www.unicore.eu/

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82. Cómo el editor de textos LaTeX puede mejorar tu productividad científica

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En el episodio de hoy he empezado a contarte qué es el editor de textos LaTeX y cómo te puede ayudar a mejorar tu productividad científica. Enlaces mencionados:

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81. DIA-DB, servidor web para prediccíón de compuestos bioactivos en el contexto de la diabetes

Enlaces relacionados:

https://bio-hpc.ucam.edu/dia-db/

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.0c00107

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80. Audiocurso sobre escritura de artículos científicos (I), entender cómo funciona el sistema

Enlaces relacionados:

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79. Linux, línea de comandos y computación científica (II)

Enlaces relacionados:

https://www.putty.org/

https://filezilla-project.org/

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78. Linux, línea de comandos y computación científica (I)

Enlaces relacionados:

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77. Cómo hago este podcast (I): grabación

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76. Post-procesar resultados de cribado virtual mediante búsquedas bibliográficas

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75. Intro al audiocurso sobre escritura de artículos

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74. Entrenamiento por intervalos

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73. Investigando el podcasting, con David García Marín

Enlaces comentados:

Paper comentado: https://revistas.ucm.es/index.php/ESMP/article/download/63723/4564456549507

Publicaciones de David García Marín: https://scholar.google.es/citations?user=DjgRxL4AAAAJ&hl=en&authuser=1&oi=sra

Twitter de David: https://twitter.com/davidsonsekinfo?lang=es

Episodios relacionados:

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72. Convocatoria de sexenios de investigación 2021 y ayuda de consultores freelance, con Olga Mínguez

Enlaces comentados:

Para contactar a Olga Mínguez: hola@olgaminguez.es

Convocatoria de Sexenios: http://www.aneca.es/Programas-de-evaluacion/Evaluacion-de-profesorado/CNEAI/Convocatoria-de-tramos-de-investigacion-de-la-CNEAI-2021

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71. Gestores de papers, mi lucha con Readcube Papers, Mendeley y Zotero

Enlaces comentados:

https://www.readcube.com/home

https://www.mendeley.com/

https://www.zotero.org/

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Estar-al-da-de-todo-lo-que-se-publica-y-researcher-app-e14gid1

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/60–Repositorios-de-preprints-y-Arxiv-Sanity-e1d1kqf

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70. Investigar métodos para aprender idiomas, Pimsleur

Enlaces comentados:

https://www.pimsleur.com/

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69. Newsletters, cómo nos pueden ayudar a aumentar el impacto de nuestra investigación, con Chus Naharro

Enlaces comentados:

https://chusnaharro.com/

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Nos-puede-ayudar-el-marketing-online-al-desarrollo-de-nuestros-proyectos-de-investigacin–joanboluda-e1cd89b

https://www.ionos.es

https://wordpress.com/es/

https://www.mailpoet.com/

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68. Química Orgánica Sintética con Antonio Leyva

Enlaces comentados:

https://itq.upv-csic.es/empleado/leyva-perez-antonio-2

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67. Investigación a través de la exploración de notas de voz

Hoy te cuento la técnica que estoy desarrollando para explorar ideas de investigación mediante notas de voz en tu smpartphone. Os propongo un reto (tenéis que escuchar el episodio para saber cuál es), y para responder podéis hacerlo mediante nota de voz a través de:

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Enlaces a episodios relacionados:

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66. Timeblocking con GTD o al revés

Enlaces comentados:

https://www.goodreads.com/book/show/1633.Getting_Things_Done

https://en.wikipedia.org/wiki/Timeblocking

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65. Efecto Mateo y la importancia de salir de nuestro contexto de investigación

Enlaces comentados:

– «Quantitative and empirical demonstration of the Matthew effect in a study of career longevity»

– https://www.pnas.org/content/108/1/18

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64. Actualidad, 24 Enero 2022

Noticias relevantes de la semana del 24 Enero de 2022.

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63. Cómo el podcasting puede beneficiar a la comunidad científica

Enlaces comentados: https://auphonic.com/ https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1364661320302497 https://everythinghertz.com Para continuar la discusión sobre el episodio, puedes hacerlo dentro de nuestra comunidad en discord: https://tinyurl.com/S3E15discord O contactarme directamente a través de: https://tinyurl.com/S3E15hps o mi email horacio@horacio-ps.com Y por último, si quieres apoyar a este podcast y además acceder a contenidos adicionales premium, puedes hacerlo suscribiéndote por 9,99€/mes a la versión premium del podcast a través de: https://tinyurl.com/S3E15prem

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62. Kaizen de Jaime Rodríguez de Santiago y cómo encontrar fuentes de información intermedias

Enlaces comentados:

  • https://auphonic.com/
  • https://www.jaimerodriguezdesantiago.com/
  • https://www.blinkist.com/en
  • https://apps.get-headway.com/
  • https://www.goodreads.com/

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61. Repetición espaciada y revisión de artículos

Enlaces comentados:

  • https://auphonic.com/
  • https://apps.ankiweb.net/
  • https://www.readcube.com/

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60. Repositorios de preprints y Arxiv Sanity

Enlaces comentados:

https://arxiv.org/

https://www.biorxiv.org/

https://chemrxiv.org/engage/chemrxiv/public-dashboard

http://www.arxiv-sanity.com/

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59. Actualidad, 17 Enero 2022

Episodio sobre noticias de investigación,, 17 Enero de 2022.

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Controlar un computador cuántico con la mente, con Lucas Lamata

Os hablo sobre el trabajo «An approach to interfacing the brain with quantum computers: practical steps and caveats»:

https://arxiv.org/abs/2201.00817

y sobre el diseño que han realizado estos investigadores sobre una prueba de concepto de conexión entre cerebro y un computador cuántico, en este caso un qbit. Además, agradezco enormemente que el profesor Lucas Lamata, co-autor del trabajo, haya respondido a preguntas claves de esta investigación y sus posibles consecuencias. La idea original del trabajo es del profesor Enrique Solano:

https://twitter.com/KikeSolanoPhys?ref_src=twsrc%5Egoogle%7Ctwcamp%5Eserp%7Ctwgr%5Eauthor

Para profundizar en computación cuántica podéis escuchar la entrevista previa que tuve con Lucas en un episodio anterior del podcast:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Qu-es-la-computacin-cuntica-y-hacia-dnde-va–Entrevista-con-LucasLamata-de-la-UniSevilla-er8pqi/a-a4pl72e

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Cómo preparar los primeros artículos de tu tesis, respuesta a Alberto Partida

Hoy respondo las dudas de un oyente del podcast sobre mejores prácticas para preparar los primeros artículos de tu tesis.

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Computación estocástica para el descubrimiento de fármacos con Josep Rosselló

Os hablo sobre el trabajo «Using Stochastic Computing for Virtual Screening Acceleration» y cómo la computación estocástica puede ser una alternativa muy interesante para acelerar los cálculos de cribado virtual. Para ello agradezco enormemente que el profesor Josep Rosselló, autor de correspondencia del paper, haya respondido a preguntas claves sobre cómo han realizado la implementación en este trabajo, que podéis encontrar en:

https://www.mdpi.com/2079-9292/10/23/2981?type=check_update&version=2

y su página personal:

https://www.uib.es/es/personal/ABTExMzIx/

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ERC Starting Grants. Piensa a largo plazo para desarrollar líneas de investigación punteras.

Te cuento sobre la convocatoria de financiación de proyectos del Consejo Europeo de Investigación, y la conveniencia de plantearla de antemano si queremos desarrollar una carrera investigadora potente. La principal noticia con los resultados de la evaluación de 2021 la podéis encontrar en: https://erc.europa.eu/news/erc-2021-starting-grants-results Para continuar la discusión sobre el episodio, puedes hacerlo dentro de nuestra comunidad en discord: https://tinyurl.com/S3E15discord O contactarme directamente a través de: https://tinyurl.com/S3E15hps o mi email horacio@horacio-ps.com Y por último, si quieres apoyar a este podcast y además acceder a contenidos adicionales premium, puedes hacerlo suscribiéndote por 9,99€/mes a la versión premium del podcast a través de: https://tinyurl.com/S3E15prem

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Encuentra nuevas relaciones entre tus ideas. PKM, Zettelkasten y Obsidian.

Os hablo sobre el proceso de volcar nuestras ideas y conocimiento en un sistema externo (PKM, Personal Knowledge Management) mediante el método Zettelkasten y con la aplicación Obsidian, y cómo esto nos puede permitir encontrar nuevas relaciones entre dichas ideas.

  • Niklas Luhmann: https://es.wikipedia.org/wiki/Niklas_Luhmann
  • Zettelkasten: https://es.wikipedia.org/wiki/Zettelkasten
  • Obsidian: https://obsidian.md/
  • How to take smart notes, de Sönke Ahrens: https://takesmartnotes.com/

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Mejorar el título de tus artículos y posts para llegar a más audiencia

Hoy os cuento una idea para incrementar el alcance del títulos de vuestras publicaciones, posts, etc, inspirándome en un interesante artículo de Tim Denning:

https://writingcooperative.com/what-i-wish-i-knew-before-becoming-a-writer-7-years-ago-526138613e39

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Inteligencia artificial interpretable para la predicción de la severidad de pacientes COVID

Hoy os cuento sobre el paper «Interpretable Machine Learning for COVID-19: An Empirical Study on Severity Prediction Task», disponible en:

https://ieeexplore.ieee.org/document/9465748

Enlaces a episodios previos sobre Interpretable Machine Learning:

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¡Los Reyes te traen un videojuego para plegar proteínas!

Mejor que el carbón, aquí tienes un videojuego donde puedes aprender a plegar proteínas, el mítico Fold-it:

https://fold.it/

y donde podrás aprender estrategias diseñadas por otros jugadores y ver cómo funciona el mundo de la ciencia colaborativa ciudadana.

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¿Nos puede ayudar la Cannabis Sativa en el contexto del Alzheimer?

¿Nos puede ayudar la Cannabis Sativa en el contexto del Alzheimer? Para que obtengáis vuestras propias respuestas, hoy os cuento sobre un paper reciente que investiga el papel del cannabidiol como inhibidor de la agregación de la proteína Tau y sus posibles consecuencias para el Alzheimer.

Enlaces comentados:

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¿Nos puede ayudar el marketing online al desarrollo de nuestros proyectos de investigación? @joanboluda

¿Nos puede ayudar el marketing online al desarrollo de nuestros proyectos de investigación? Hoy os comento sobre esta idea y en relación a ello os hablo sobre Joan Boluda y su podcast y negocio «Marketing online»:

https://open.spotify.com/show/2D42bidPAdkxoViddqnPAs

https://boluda.com/

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¿Se puede investigar sin oficina?

¿Se puede investigar sin oficina? ¿Y sin afiliación? Hoy os introduzco esta reflexión, directamente grabado desde el coche, y en relación a ello os comento sobre Bosco Soler y su web «Sin oficina»:

https://sinoficina.com/

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Por qué hago este podcast (I)

Si quieres saber por qué hago este podcast, escucha el episodio 🙂

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Control dinámico del consumo de agua de las plantas mediante bioinformática estructural

Hoy te comento sobre el artículo «Dynamic control of plant water use using designed ABA receptor agonists»:

https://www.science.org/doi/10.1126/science.aaw8848

de Sean Cutler, de la Universidad de California, Riverside:

https://www.researchgate.net/profile/Sean-Cutler

y la posibilidad de expandir las herramientas de bioinformática estructural, no solo al descubrimiento de fármacos, si no también al de contextos agroquímicos, particularmente el poder reducir el agua que necesitan las plantas.

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Scientific intuition inspired by machine learning-generated hypotheses

Te cuento sobre el interesante artículo «Scientific intuition inspired by machine learning-generated hypotheses» que puedes encontrar en:

https://iopscience.iop.org/article/10.1088/2632-2153/abda08/meta

de Alan Azpuru-Guzik

https://www.researchgate.net/profile/Alan-Aspuru-Guzik

y Pascal Friederich:

https://www.researchgate.net/profile/Pascal-Friederich

Siendo este el episodio donde te he comentado el proyecto de Interpretable Machine Learning en el cáncer colorrectal:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Proyecto-Europeo-H2020-REVERT-Medicina-personalizada-mediante-inteligencia-artificial-etpfse

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MetaScreener: cribado virtual de candidatos a fármacos en supercomputadores

Te cuento sobre la herramienta que hemos desarrollado en nuestro grupo de investigación BIO-HPC para realizar cálculos de descubrimiento de fármacos en supercomptudores.

Puedes obtenerla del repositorio github:

https://github.com/bio-hpc/metascreener

Y aquí puedes ver varias de las publicaciones donde la hemos usado:

http://bio-hpc.eu/publications/peer-rev/

Siendo este el episodio donde te he comentado el proyecto de la lipasa gástrica:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Lo-que-hay-detrs-de-un-proyecto-de-investigacin–Identificacin-de-compuestos-para-la-prdida-de-peso–con-Teresa-del-Castillo-y-Julia-Maldonado-de-la-UGR-y-Juan-Jos-Hernndez-Morante-de-la-UCAM-e134uko

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Cómo gestionar proyectos en diferentes colaboraciones mediante aplicaciones consolidadas: Akiflow

Hoy hablamos sobre cómo gestionar proyectos en diferentes colaboraciones mediante aplicaciones consolidadas y mencionamos Akiflow:

https://akiflow.com

y la entrevista que tuve con su CEO Nunzio Martinello en la versión inglesa de este podcast:

https://anchor.fm/horacio-perez-sanchez/episodes/How-can-you-be-more-productive-in-your-research-using-consolidated-apps-Akiflow-e1br7de/a-a7440ot

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PD: Música de fondo «Balearic Paradox» tomada de «Keep Calm and Podcast»:

https://pod.co/keep-calm-and-podcast

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Cómo el editor de textos LaTeX puede mejorar tu productividad científica

Hoy te cuento qué es el editor de textos LaTeX y cómo te puede ayudar a mejorar tu productividad científica. Enlaces mencionados:

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Únete a un Journal Club para aprender cómo acceder a recursos GPU gratis en Google Colab

Hoy te cuento lo útil que es un Journal Club y lo útil que puede ser para profundizar mediante una lectura o discusión en grupo sobre un paper. Para ello te hago un resumen del primer journal club que hemos organizado a través de la comunidad discord en torno al área en la que trabajar nuestro grupo de investigación, Structural Bioinformatics and High Performance Computing (BIO-HPC):

https://discord.gg/fZyNYTsT7k

donde hemos discutido sobre el paper «Making it Rain: Cloud-Based Molecular Simulations for Everyone»:

https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jcim.1c00998

En el episodio de la versión en inglés de este podcast puedes encontrar el Live Journal Club que tuvimos junto al primer autor del paper:

https://anchor.fm/horacio-perez-sanchez/episodes/Making-it-Rain-Cloud-Based-Molecular-Simulations-for-Everyone-with-Pablo-Arantes-in-our-Journal-Club-e1b9eif

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Investigando el análisis de datos

En el episodio de hoy, primero de la tercera temporada del podcast, tenemos una mesa redonda en torno al tema del análisis de datos, desde una perspectiva tanto académica como de startup/empresa. Para ello agradezco enormemente que hayan podido venir los siguientes expertos en al área:

Escuchadlo porque ha sido una discusión super interesante donde hemos tratado temas tales como buenas prácticas para el análisis de datos, big y low data, cómo monetizar los análisis y lo que está por venir, entre otras cosas.

Si os ha gustado el episodio, podéis continuar la discusión sobre él dentro de nuestra comunidad en discord:

https://discord.gg/45UXuqVPvY

¡Gracias!

PD: Música de fondo «Balearic Paradox» tomada de «Keep Calm and Podcast»:

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Random 28 Noviembre 2021

Episodio corto y random grabado en directo en la calle. Perdón por la calidad del audio.

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

https://forms.gle/MAjcj3ErmJ3BquC56

o continuar la discusión sobre él en nuestro servidor de discord:

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¡Gracias!

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Cierre de la segunda temporada y episodios de suscripción

Último episodio de la segunda temporada donde comento brevemente el feedback general de los oyentes, y los nuevos episodios bajo suscripción con los cuales puedes apoyar directamente al podcast. Para ello puedes encontrar el enlace de suscripción tanto a través de Anchor con el botón «suscribir»:

como a través de Spotify.

¡Gracias!

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Lo que hay detrás de un proyecto de investigación. Identificación de compuestos contra el cáncer colorrectal, con Irene Martínez del IMIB y Victor Mulero de la UMU

En el episodio de hoy, de la serie «Lo que hay detrás de un proyecto de investigación» ,contamos el trabajo que hemos desarrollado en conjunto el grupo BIO-HPC de la UCAM junto con Irene Martínez del IMIB y Victor Mulero de la UMU para reposicionar fármacos en el contexto del cáncer colorrectal.

La web del grupo de Irene Martínez la podéis encontrar en:

http://www.hematoncologia.com/

y aquí su lista de publicaciones:

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=14012015600

Por otra parte aquí podéis encontrar las publicaciones de Victor Mulero:

https://www.researchgate.net/profile/Victoriano-Mulero

y aquí la web del grupo BIO-HPC y publicaciones de Horacio Pérez:

https://bio-hpc.eu

Si os ha gustado el episodio, podéis continuar la discusión sobre él dentro de nuestra comunidad en discord:

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¡Gracias!

Referencia a las patentes relacionadas:

– H. Pérez-Sánchez, I. Martínez-Martínez, J. Peña-García, A. Rodenas-Bleda, J. Peñas-Martínez, D. Zaragoza-Huesca, “Nuevo tratamiento del cáncer colorrectal”. P202130064 (2021).

– 12. H. Pérez-Sánchez, I. Martínez-Martínez, J. Peña-García, A. Carmona-Bayonas, M. Rodenas-Bleda, J. Peñas-Martínez, D. Zaragoza-Huesca, V. Mulero-Méndez, I. Pardo-Sánchez, S. Espín-García, “Nuevo tratamiento del cáncer colorrectal”. P202130871 (2021).

Agradecimientos: This work was supported by the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, Grant Number PI17/00050 & FEDER and the generous donations to Crowdfunding Precipita (FECYT).

This work has been funded by grants from Fundación Séneca del Centro de Coordinación de la Investigación de la Región de Murcia [Project 20988/PI/18]; and the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness [CTQ2017-87974-R].

Supercomputing resources in this work have been supported by the Poznan Supercomputing Center’s infrastructures, the e-infrastructure program of the Research Council of Norway, and the supercomputing center of UiT—the Arctic University of Norway, by the Plataforma Andaluza de Bioinformática of the University of Málaga, by the supercomputing infrastructure of the NLHPC (ECM-02, Powered@NLHPC), and by the Extremadura Research Centre for Advanced Technologies (CETA−CIEMAT), funded by the European Regional Development Fund (ERDF). CETA−CIEMAT belongs to CIEMAT and the Government of Spain.

Maria Carmen Ródenas holds a grant from the Spanish Society of Thrombosis and Haemostasis (SETH), David Zaragoza-Huesca holds a predoctoral FPU grant from the Spanish Ministry of Science, and Irene Martínez-Martínez holds a Miguel Servet contract (CPII18/00019) from the Instituto de Salud Carlos III (Madrid).

PD: Imagen original tomada de:

https://commons.wikimedia.org/wiki/File:7-min.svg

Música de fondo «Let the sunshine» tomada de «Keep Calm and Podcast»:

https://pod.co/keep-calm-and-podcast

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Técnica de los 7 minutos para progresar cuando nos falta la energía o motivación

En el episodio de hoy os comento una técnica que me da resultados fenomenales para poder avanzar en mi trabajo en aquellos momentos en que estoy muy bajo de energía y que llamo la técnica de los 7 minutos.

Si os gusta, podéis continuar la discusión sobre él dentro de nuestra comunidad en discord:

https://discord.gg/45UXuqVPvY

¡Gracias!

PD: Imagen original tomada de:

https://commons.wikimedia.org/wiki/File:7-min.svg

Música de fondo «Wind Down» tomada de «Keep Calm and Podcast»:

https://pod.co/keep-calm-and-podcast

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Conseguir financiación en convocatorias Europeas con una consultora: Eurovértice

Hoy hablamos sobre cómo conseguir financiación para proyectos de investigación en convocatorias Europeas con la ayuda de una consultora. Nos centramos en financiación Europea y en la consultora Eurovértice, situada en la Región de Murcia:

https://www.eurovertice.eu/

Para ello entrevistamos a Lahila De Sola Carrón:

https://www.eurovertice.eu/en/staff/lahila-de-sola-carron/

Os refiero también a dos episodios previos del podcast, el S2E3 relacionado de manera general con las convocatorias de financiación:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Convocatorias-de-financiacin-para-investigacin-e119km6

y el S1E7, relacionado con nuestro proyecto H2020 REVERT de inteligencia artificial en medicina personalizada donde explico todo el proceso:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Proyecto-Europeo-H2020-REVERT-Medicina-personalizada-mediante-inteligencia-artificial-etpfse

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

https://forms.gle/MAjcj3ErmJ3BquC56

o continuar la discusión sobre él en nuestro grupo de Telegram:

https://t.me/investig_ando

¡Gracias!

PD: Imagen original tomada de la web de Eurovértice. Música de fondo «Let the Sunshine» tomada de

https://pod.co/keep-calm-and-podcast

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La multitarea nos puede ayudar a desbloquear procesos en investigación

Episodio de la serie productividad para investigadores. Hoy cuento cómo aplicar la multitarea para poder trabajar al mismo tiempo en varios proyectos clave de investigación o creativos tales como pueda ser redactar papers, proyectos escribir libros, etc.

Me puedes contactar en horacio (at) horacio-ps.com si quieres participar en el próximo webinar interactivo que organizaré para dar más detalles de estas técnicas.

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

https://forms.gle/MAjcj3ErmJ3BquC56

o continuar la discusión sobre él en nuestro grupo de Whatsapp:

https://chat.whatsapp.com/KCl7t8KBcR258bpi0HHbDG

¡Gracias!

PD: Imagen original tomada de:

https://thenounproject.com/term/multitasking/995438/

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Evitar procrastinar en nuestras tareas investigadoras

Episodio corto sobre cómo evitar procrastinar en nuestras tareas investigadoras.

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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o continuar la discusión sobre él en nuestro grupo de Whatsapp:

https://chat.whatsapp.com/KCl7t8KBcR258bpi0HHbDG

Y aquí puedes acceder al resto de episodios del podcast:

https://horacio-ps.com

¡Gracias!

PD: Imagen original en: https://www.stockvault.net/data/2020/01/21/272697/preview16.jpg

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Avanzar rápido aunque rompas cosas, aplicar regla del 70% a proyectos en investigación

Episodio corto grabado en directo en la calle sobre mi cómo avanzar rápido en investigación mediante la regla del 70%. Opinión personal y también reflejada por Taylor Nelson en este post:

https://www.firstrepublic.com/innovators/articles-insights/the-70-percent-rule-why-you-should-move-fast-and-break-things

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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https://chat.whatsapp.com/KCl7t8KBcR258bpi0HHbDG

Y aquí puedes acceder al resto de episodios del podcast:

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¡Gracias!

PD: Imagen tomada de

https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mark_Zuckerberg_-_Move_Fast_and_Break_Things.jpg

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Cómo explorar ideas de investigación mediante la grabación de un podcast

Episodio corto grabado en directo en la calle sobre cómo explorar ideas de investigación mediante la grabación de un episodio de podcast y su posterior seguimiento.

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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Grupos de investigación y startups: similitudes y diferencias

Este es otro episodio en la serie sobre startups. Hoy comentamos las principales diferencias y similitudes entre grupos de investigación y startups, basándome en un post muy interesante de Charl Botha, de la Universidad de Delft:

https://cpbotha.net/2012/07/24/startups-vs-academic-research-groups-fight/

es una exploración de ideas interesante y donde podéis escoger la casuística que preferís. También os dejo una reflexión al final del episodio sobre el tema.

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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Por otra parte, os paso también el enlace para votar a los premios iVoox 2021 con este podcast si os apetece!

https://es.surveymonkey.com/r/PremiosIvooxAudiencia2021?utm_source=twitter_ivooxawards21&utm_medium=social&utm_content=votar&utm_campaign=ivooxawards2021

¡Gracias!

PD: Imagen tomada de:

https://pixabay.com/illustrations/businessman-startup-success-arrow-2330853/

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Cómo realizamos el descubrimiento de fármacos computacional (I): Blind docking

Hoy he realizado un primer capítulo donde me centro en la investigación de nuestro grupo BIO-HPC en la UCAM. En este primer episodio de esta serie introduzco el tema del descubrimiento de fármacos computacional, con una de las técnicas que hemos desarrollado en nuestro grupo, el Blind Docking, que supera en muchos aspectos al docking molecular tradicional.

He comentado también sobre nuestro software de docking en GPU llamado METADOCK 2:

https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/11/1515/5711286?redirectedFrom=fulltext

y sobre Achilles Blind Docking Server, nuestro servidor web donde implementamos este método para que se pueda usar de manera muy sencilla:

https://bio-hpc.ucam.edu/achilles/

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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Cómo afectan a nuestra productividad investigadora las apps instaladas en nuestro móvil

Episodio corto grabado en directo en la calle sobre cómo mejorar drásticamente tu productividad investigadora poniendo atención a las aplicaciones que tienes instaladas en tu móvil.

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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https://chat.whatsapp.com/KCl7t8KBcR258bpi0HHbDG

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Posición postdoc OMICS y machine learning en nuestro grupo

Episodio corto grabado en directo en la calle sobre puesto postdoc OMICS y machine learning en nuestro grupo. Aquí el enlace al episodio anterior del podcast donde se explico más en detalle el proyecto REVERT: https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Proyecto-Europeo-H2020-REVERT-Medicina-personalizada-mediante-inteligencia-artificial-etpfse

Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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Scientific career and advice for PhD students

En el episodio de hoy os paso la entrevista que me hicieron Eva Lantsoght y Rico Massa en su maravilloso podcast sobre Academia y Doctorandos «PhD Talk»:

Podcast

¡os recomiendo encarecidamente seguir su podcast!

La entrevista fue en inglés y ello me ha dado que pensar y a partir de ahora he creado una «versión» (no es esa la mejor palabra, pero ahora mismo no se me ocurre otra) de este podcast en inglés, donde seguiré en principio la misma línea que he establecido aquí, tenéis el enlace aquí para acceder y suscribiros:

https://anchor.fm/horacio-perez-sanchez 

Finalmente, podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio:

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Bioinformática estructural para biotecnólogos

En este episodio os paso la entrevista que me hizo la asociación de biotecnólogos de la Región de Murcia y donde cuento la investigación que hacemos en nuestro grupo de investigación BIO-HPC (http://bio-hpc.eu) y otras aplicaciones de la bioinformática estructural en áreas biotecnológicas. Podéis dejar aquí vuestra opinión, preguntas o comentarios el episodio: 

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Colaboraciones científicas, cuándo son necesarias y cómo encontrarlas (I)

Episodio corto grabado en directo en la calle sobre colaboraciones científicas, cuándo son necesarias y cómo encontrarlas. Parte I.

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Estar al día de todo lo que se publica y researcher.app

Episodio corto grabado en directo en la calle sobre si es posible estar al tanto d de todo lo que se publica y os cuento mi experiencia con la app researcher (https://www.researcher-app.com) y os pido opinión sobre vuestros métodos.

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Acelerar la curación de lesiones musculares con Rubén Rabadán Ros

Hoy hablamos con Rubén Rabadán Ros:

https://www.linkedin.com/in/rub%C3%A9n-rabad%C3%A1n-ros/?originalSubdomain=es

investigador postdoctoral en el Instituto Salk en California, quien nos cuenta. entre otros, el último trabajo en el que ha participado, relacionado con la reducción del tiempo de curación de las lesiones musculares:

https://www.researchgate.net/publication/351843291_In_vivo_partial_reprogramming_of_myofibers_promotes_muscle_regeneration_by_remodeling_the_stem_cell_niche

además de otros aspectos muy interesantes sobre su carrera investigadora, actual estancia en California y sus planes de investigación de futuro.

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Contratos predoctorales y postdoctorales. Posibilidades en nuestro grupo.

En este primer episodio introductorio contamos las diferentes maneras en que puede funcionar un grupo de investigación en cuanto al personal que participa en sus proyectos y las opciones que hay para financiarlos. También explicamos las posibilidades de contratos predoctorales y postdoctorales que tenemos ahora mismo abiertos en nuestro grupo de investigación y que puedes consultar aquí en más detalle:

https://bio-hpc.eu/job-opportunties/2021-phd-and-postdoc-positions/

En cuanto al proyecto REVERT que se menciona, ya hicimos un episodio anterior:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Proyecto-Europeo-H2020-REVERT-Medicina-personalizada-mediante-inteligencia-artificial-etpfse

y otro relacionado con las convocatorias de financiación para investigación:

https://anchor.fm/horacio-ps/episodes/Convocatorias-de-financiacin-para-investigacin-e119km6

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